Створена нова технологія масового секвенування білків
Більшість з вас напевно чули про секвенировании ДНК і РНК. А вони, як відомо, складаються з амінокислот. При цьому, що дивно, для визначення амінокислотної послідовності білків подібних методів поки що не існує. Точніше, не існувало. Адже нещодавно група дослідників з США запропонувала спосіб, як це зробити. Причому новий метод дозволяє більш глибоко вивчити ряд процесів вперше за 40 років з моменту відкриття можливості секвенування.
Новий спосіб вчені назвали «методи секвенування наступного покоління — Next Generation Sequencing (NGS). Ці методи дозволяють одночасно аналізувати кілька молекул нуклеїнових і амінокислот. Виглядає все досить просто: «суміш» кислот «розрізаються» в рандомних місцях на одноцепочечные шматки. Потім вони «добудовуються» за принципом комплементарності. Тобто певної кислоті відповідає тільки одна подібна. При цьому кожне з’єднання супроводжується спалахом. Ці спалахи фіксуються і переводяться код.
По суті в цьому немає нічого нового і позожим чином відбувається і звичайне секвенування. Але група дослідників з Техаського університету в Остіні адаптувала ці методи для прямого секвенування білків. В їх підході також використовуються флуоресцентні мітки, але при цьому молекули не «розбираються і добудовуються». Вони розбираються по шматочках за допомогою спеціальної реакції. І спалаху від «розборки» фіксуються приладом. Однак такий підхід ускладнює розпізнавання з-за того, що можуть залишитися невеликі фрагменти. Для вирішення цього завдання вчені використовують мас-спектрометрію. «Зайвий» ділянку просто проганяється через спектрометр на визначення відповідності можливим комбінаціям білків.
Масове секвенування білків допоможе проводити глибокий аналіз різних захворювань, а також більше дізнатися про процеси, що протікають в організмі.